申泮文特別重視“基礎”和“傳統(tǒng)”，他說，西南聯(lián)大和南開在中國教育史上的重要意義，就在于樹立了真正的大學精神，并確立了很好的人才培養(yǎng)模式。“老教授、名教授堅持給本科生上課，這種情況在國際知名大學其實比較普遍，只是國內越來越稀有，這是不正常的！”在他看來，名教授上課，不僅是一種形式，更是傳達一種氣質，一種滲入骨髓的對真理的思辨與追求，能對青年學生產生巨大的影響。“我希望南開能夠保持這個傳統(tǒng)，全國的大學也都能一起把它發(fā)揚光大。”

1980年，從山西大學回到南開大學擔任無機化學教研室主任的申泮文，面對人才短缺的情況，提出“培養(yǎng)高層次人才，應該立足于國內”的主張。他以建設無機化學重點學科為目標，制定了3個“五年計劃”：以“傳、幫、帶”的形式，在第一個5年培養(yǎng)出一批副教授，第二個5年培養(yǎng)一批教授，第三個5年之內培養(yǎng)出一批年富力強的博士生導師。他倡導并恢復了助教制度：聘請品學兼優(yōu)、責任心強的本科畢業(yè)生擔任助教，專職助課、輔導、批改作業(yè)和實驗報告，畢業(yè)后培養(yǎng)他們在職直接攻博，這樣既提高了本科教學質量，同時也發(fā)現(xiàn)、培養(yǎng)了一大批優(yōu)秀教學人才。他的這一培養(yǎng)教師的模式于1989年獲得優(yōu)秀教學成果獎。

此外，申泮文還安排開展了無機合成、配位化學、生物無機化學3個方向的科研工作，開設了一整套質量較高的研究生學位課程，為教師成長創(chuàng)造了良好的條件和環(huán)境。到1996年，南開大學無機化學學科脫穎而出，培養(yǎng)出教授19人、副教授17人、博士生導師7人，擁有在學博士、碩士50多位；建立起了新能源材料化學和應用化學兩個研究所，承擔“863計劃”和“973計劃”的多個研究項目，共取得國內外專利30項。

2008年，申泮文帶領的南開大學無機化學創(chuàng)新教學團隊，入選教育部、財政部批準的我國首批國家級教學團隊，成為化學教學領域的國家隊。如今他的團隊中有院士，有長江學者，還有國家級教學名師，先后獲得3項國家級教學成果一等獎。

面對高校中漸盛的“重科研輕教學”風氣，申泮文如鯁在喉，經常在各種場合呼吁：“教師要在教學改革上多用力。”

人生的最后幾年，申泮文最關注的還是教學改革，他最后承擔的項目課題是關于“化學學科教育教學體系的改革”。即使躺在病床上，他依舊不斷向前來探望的學校領導、同事和學生詢問教學改革的進展。

申泮文曾經這樣闡述他對化學這門古老學科的理解：“沒有一門科學能像化學這樣創(chuàng)造出新的物質，因此化學是一門創(chuàng)造新世界的科學。”申泮文教授在講課或演講中，經常與同學們互動，有問必答，有惑必解。他說：“我不喜歡那種鴉雀無聲的課堂。因為只有在思想的碰撞中，才能濺出創(chuàng)新的火花！”

在人們眼中，申泮文一直是一個不保守、喜歡“趕時髦”的人。他80歲開始學電腦，90歲時在網(wǎng)上開通博客，成為我國年齡最大的網(wǎng)絡寫手。申泮文把博客當成“延伸出去的黑板”，學生們既是他的弟子，也是他的“粉絲”。2015年9月10日，正值我國第31個教師節(jié)，南開大學為申泮文舉行了一場特別的“生日會”，家人、朋友、同事、學生以及學校代表紛紛從全國各地趕來為先生祝壽。

由于身體原因，申泮文未能來到大會現(xiàn)場，他通過視頻向到場嘉賓表示感謝。他略微得意地說：“眼下，聯(lián)合國教科文組織正在青島召開國際教育信息化大會。而我是從1985年開始就在南開大學化學系開展了信息教育嘗試，比聯(lián)合國教科文組織推廣這項工作整整早了30年！”

作為化學教育家，申泮文不僅注重培養(yǎng)學生的專業(yè)興趣和學習能力，還特別強調愛國主義教育。他認為，南開學校之所以培養(yǎng)了無數(shù)治國良才，是與南開精神密不可分的。他經常對學生說：“我經歷過抗日戰(zhàn)爭，深刻感受到愛國主義氛圍對人才培養(yǎng)的重要性。”

申泮文是一位沒有出國留學、沒有博士學位的中科院資深院士，但是他積極創(chuàng)造條件讓青年師生出國深造，參加國內外各種形式的教學培訓和交流研討。他常對學生講：“科學技術沒有國界，可是科學家有祖國，科學家的社會責任是為祖國人民謀福利”。